Una dintre principalele probleme apare în momentul în care șina veche este dezafectată și încep lucrările de săpătură. În paralel cu lucrările la șine, sunt necesare intervenții asupra rețelelor de apă, gaze și termoficare, ceea ce presupune coordonarea mai multor operatori. Primarul general Ciprian Ciucu susține că lucrările trebuie realizate astfel încât infrastructura modernizată să nu necesite intervenții majore în următorii ani. Municipalitatea precizează că, atunci când lucrările sunt blocate într-o anumită zonă, muncitorii sunt redirecționați către alte porțiuni ale aceluiași șantier sau către alte loturi. Primăria Capitalei spune că în unele zone au fost descoperite inclusiv vestigii care trebuie analizate de Ministerul Culturii, ceea ce poate contribui, la rândul său, la prelungirea duratei intervențiilor.